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r /> 陈峥一窒,怎么又扯到我这里了。罢了罢了,反正这个之前吹下的牛逼已经圆不回来了,干脆爱咋咋地吧。
于是,陈峥神色一正:“其实当时给您看的那个,只是一个不太成熟的想法。其实无论Zfn还是Cas,其内核都是那颗能够缀合DNA识别域的万用内切酶。唯一的区别,在于这两把‘万能钥匙’的‘材质’不同。”
“Zfn使用的DNA识别域是锌指向蛋白,通过锌指向蛋白和目标DNA的契合来寻找指定的‘锁孔’,然后打开DNA长链。而Crispr使用的是识别域是RNA。我们都知道,锌指向蛋白和DNA的契合虽然精准,但条件十分苛刻,同时由于蛋白的体积比DNA碱基要大得多,如果识别域过长,就会由于空间问题,造成难以契合。”
“而RNA与DNA的契合则要容易得多,碱基间配对本身就是正常的生物大分子反应。所以您才会认为Crispr比Zfn的前景更广阔,对吧?”
杨教授点了点头,虽然陈峥比喻的很通俗,但是事实却是也是如此。
“那么问题也就来了。”陈峥不自觉的又拿出了在课堂上讲课的派头,好在杨院长并不在意,甚至还对他这种“天生的讲台范儿”有几分欣赏。
“就好比金属焊接。Zfn是将内切酶和锌指向蛋白焊接在一起,两者都是蛋白质,就如同铁与铁焊接,焊缝自然稳定坚固。但是Crispr是内切酶和RNA焊接,就像将铁与其他金属焊接起来,无采用什么样的焊药,焊缝肯定不会太稳固。所以,导向RNA丢失,是Crispr不能得到广泛应用的最关键问题。”
杨教授兴致勃勃的问道:“你既然知道问题所在,那么你打算怎么解决呢?”
“其实说起来很简单。”陈峥打了个响指:“用我们用‘榫卯’。将导向RNA长链中的三分之二或者更长部分包裹在蛋白的内部空间中,通过加长这段不牢固的‘焊缝’来提高稳固性,然后利用RNA露出的‘尾巴’作为DNA识别域。”
杨教授眼前一亮,这个思路确实很有可行性啊!
当然有可行性了,其实这就是Jansen在十年之后拿出的第五代Crispr技术,Cas-9蛋白的原理啊!在陈峥所在的后世,第五代Crispr/cas9技术,已经成为了应用最广泛的基因编辑技术,没可行性才怪了!
精神矍铄的老教授显得十分兴奋:“那么你打算什么时候开始做这方面的研究?既然已经有了方向,干脆就别耽误了,我这就给你安排人手和资源,咱们现在就就开始!”
得,又给自己挖坑了。
陈峥苦笑着摇摇头:“我的好导师,您别急啊。您知道cas系列蛋白是在什么菌株中表达的吗?没有合适的‘工厂’,咱们就算造出了零件,也组装不起来啊。”
杨教授顿时有些尴尬,看向自己学生的眼神也带着几分躲闪:“那么,我们现在还需要做什么工作?”
“古代巨杆菌。”陈峥说出了一个名词。
杨教授一窒:“不好办啊,这东西咱们国内好像还没有。国外研究机构可不一定会共享这些样本。”
“所以就得靠学校了。”陈峥笑着说:“您运作运作,看看我们能不能搭上极地科考队的顺风车,今年冬天去南极圈度个假。”
……
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r /> 陈峥一窒,怎么又扯到我这里了。罢了罢了,反正这个之前吹下的牛逼已经圆不回来了,干脆爱咋咋地吧。
于是,陈峥神色一正:“其实当时给您看的那个,只是一个不太成熟的想法。其实无论Zfn还是Cas,其内核都是那颗能够缀合DNA识别域的万用内切酶。唯一的区别,在于这两把‘万能钥匙’的‘材质’不同。”
“Zfn使用的DNA识别域是锌指向蛋白,通过锌指向蛋白和目标DNA的契合来寻找指定的‘锁孔’,然后打开DNA长链。而Crispr使用的是识别域是RNA。我们都知道,锌指向蛋白和DNA的契合虽然精准,但条件十分苛刻,同时由于蛋白的体积比DNA碱基要大得多,如果识别域过长,就会由于空间问题,造成难以契合。”
“而RNA与DNA的契合则要容易得多,碱基间配对本身就是正常的生物大分子反应。所以您才会认为Crispr比Zfn的前景更广阔,对吧?”
杨教授点了点头,虽然陈峥比喻的很通俗,但是事实却是也是如此。
“那么问题也就来了。”陈峥不自觉的又拿出了在课堂上讲课的派头,好在杨院长并不在意,甚至还对他这种“天生的讲台范儿”有几分欣赏。
“就好比金属焊接。Zfn是将内切酶和锌指向蛋白焊接在一起,两者都是蛋白质,就如同铁与铁焊接,焊缝自然稳定坚固。但是Crispr是内切酶和RNA焊接,就像将铁与其他金属焊接起来,无采用什么样的焊药,焊缝肯定不会太稳固。所以,导向RNA丢失,是Crispr不能得到广泛应用的最关键问题。”
杨教授兴致勃勃的问道:“你既然知道问题所在,那么你打算怎么解决呢?”
“其实说起来很简单。”陈峥打了个响指:“用我们用‘榫卯’。将导向RNA长链中的三分之二或者更长部分包裹在蛋白的内部空间中,通过加长这段不牢固的‘焊缝’来提高稳固性,然后利用RNA露出的‘尾巴’作为DNA识别域。”
杨教授眼前一亮,这个思路确实很有可行性啊!
当然有可行性了,其实这就是Jansen在十年之后拿出的第五代Crispr技术,Cas-9蛋白的原理啊!在陈峥所在的后世,第五代Crispr/cas9技术,已经成为了应用最广泛的基因编辑技术,没可行性才怪了!
精神矍铄的老教授显得十分兴奋:“那么你打算什么时候开始做这方面的研究?既然已经有了方向,干脆就别耽误了,我这就给你安排人手和资源,咱们现在就就开始!”
得,又给自己挖坑了。
陈峥苦笑着摇摇头:“我的好导师,您别急啊。您知道cas系列蛋白是在什么菌株中表达的吗?没有合适的‘工厂’,咱们就算造出了零件,也组装不起来啊。”
杨教授顿时有些尴尬,看向自己学生的眼神也带着几分躲闪:“那么,我们现在还需要做什么工作?”
“古代巨杆菌。”陈峥说出了一个名词。
杨教授一窒:“不好办啊,这东西咱们国内好像还没有。国外研究机构可不一定会共享这些样本。”
“所以就得靠学校了。”陈峥笑着说:“您运作运作,看看我们能不能搭上极地科考队的顺风车,今年冬天去南极圈度个假。”
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